Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Efnb1P52795 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Efnb1P52795 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Efnb1P52795 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Efnb1P52795 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Efnb1P52795 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Efnb1P52795 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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