Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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GdnfP48540 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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GdnfP48540 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GdnfP48540 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms