Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms