Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NodalP43021 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NodalP43021 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms