Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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