Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TfamP40630 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TfamP40630 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TfamP40630 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TfamP40630 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TfamP40630 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TfamP40630 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TfamP40630 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms