Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rom1P32958 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rom1P32958 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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