Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms