Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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