Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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