Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms