Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RarbP22605 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RarbP22605 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RarbP22605 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RarbP22605 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RarbP22605 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RarbP22605 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms