Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms