Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms