Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb1P12658 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Calb1P12658 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Calb1P12658 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Calb1P12658 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms