Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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P10404 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P10404 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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