Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms