Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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