Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms