Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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