Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms