Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r34G3XA52 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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