Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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