Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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