Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10378F6XQQ1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms