Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccdc71lE9Q4T4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms