Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cfap46E9Q2C0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cfap46E9Q2C0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms