Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx60E9PZQ1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx60E9PZQ1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx60E9PZQ1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddx60E9PZQ1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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