Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd1E9PZ26 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms