Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms