Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SafbD3YXK2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms