Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.6 ms