Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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