Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms