Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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