Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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