Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hacd4A2AKM2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hacd4A2AKM2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms