Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Prdm12A2AJ77 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Prdm12A2AJ77 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prdm12A2AJ77 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms