Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34dA2AGU5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms