Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pramef6A2A8M8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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