Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms