Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms