Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skp2Q9Z0Z3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skp2Q9Z0Z3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms