Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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