Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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