Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trpc3Q9QZC1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc3Q9QZC1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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