Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms