Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rad18Q9QXK2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms