Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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