Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms